按照“礼乐相成”的思想要求，书院建筑是社会群体意识的表现，每一所书院都有包括山门、讲堂、祠堂、书楼、斋舍在内的建筑群。这种建筑群从每个殿堂厅房所居的位置、装饰到总体格局都遵循纲常礼教的严谨秩序，使书院师生置身于一种浓厚的政治伦常的观念和秩序之中。这一切，正是儒家之道的世俗性的一面。由于地形地貌的限制，紫阳书院的建筑有所不同。

　　紫阳书院山门：坐北朝南，位于紫阳洞口石台南面两座小石岩狭窄过道。通过由下而上九十多步石阶(该石阶共约一百一十五级)，就能见到紫阳书院大门，书院大门为重檐庑殿顶塔式牌坊，面阔2.8米，高5.9米，到达正门前，抬头仰视显得院门高大雄伟，这代表了书院显赫的社会地位同，表示儒教的崇高伟大尊严。门楣上方嵌石额，横向阴刻楷书“紫阳洞”三字。门两侧有楹联：“潕水无双福地;黔山第一洞天。”这里的“福地”，指神仙居住之处，道教有七十二福地之说，亦指幸福安乐的地方，旧时常用以称道观。“洞天”意谓山中有洞室通达上天，贯通诸山。东晋《道迹经》云：“五岳及名山皆有洞室。”对联高度赞扬该书院;潕阳河流域其他地方绝无此福地，整个黔地只有此处才是第一处仙境。

　　紫阳书院讲堂：凡书院都有讲堂，因为讲学是书院最基本的活动，讲堂则是用来讲学的场所。有的书院是前堂后祠，有的书院是前祠后堂。紫阳书院应该是前堂后祠，以突出其讲学的最基本活动。紫阳书院讲堂设在考祠的第一层。讲堂的基本功能是讲学，但书院从本质上看仍然是“学校”，这就必然存在着考试，讲堂也就成了书院考课的基本场所。还因为二层为祠堂。紫阳书院为了督促生童们认真读书，起到振兴教育的作用，往往把学规、学约刻于书院的讲堂。

　　紫阳书院祠堂：书院的祠堂，据记载应在考祠的上层，即二层厅室为祠堂。考祠二层供祀南宋理学大师朱熹牌位 ，朱熹是唯一非孔子亲传弟子而享祀孔庙，位列大成殿十二哲者中，受儒教祭祀。朱熹是“二程”(程颢、程颐)的三传弟子李侗的学生，与二程合称“程朱学派”。朱熹的理学思想对元、明、清三朝影响很大，成为三朝的官方哲学，是中国教育史上继孔子后的又一杰出人物。顶层供祀尧、舜、禹“三元三品、三官大帝”。按规制，顶层应供祀孔子塑像，或塑文昌帝君和魁星之像。考祠中层是书院的中心，也是书院的重要标志之一。这是书院进行祭祀与德育教育的场所，一般位于书院的前面或中央。祠宇内力求宽敞肃穆，除安有朱熹牌位之外，还安置各位先贤、先儒、书院创办人等牌位。祠堂的墙壁上还应张贴有朱熹的《岳麓书院学规》，即：时常省问父母;朔望恭谒圣贤;气习名矫偏处;举止整齐严肃;服食宜从俭素;外事毫不可干;行坐必依齿序;痛戒讦短毁长;损友必须拒绝;不可闲谈废时;日讲经书三起;日看《纲目》数页;通晓时务物理;参读古文诗赋;读书必须过笔;会课按时蚤完;夜读仍戒晏起;疑误定要力争。这样的设置、布置可以使生童随时瞻仰先贤，无不肃然起敬，成为他们耳濡目染中自然传承的文化传统，明显起到“推重学统，加强教导”的作用。

　　紫阳书院藏书楼：有的书院把“藏书楼”称作“尊经阁”，还有的书院建有“五经馆”。书院的重要职能之一是藏书，藏书楼、尊经阁、五经馆正是藏书的地方，书院藏书主要有“经史子集”等书籍。《镇远府志·艺文·青龙洞简述》载：“在明嘉靖九年(公元1530年)庚寅，经知府黄希英建‘紫阳书院’于此，附祀朱文公牌位于其中。工部郎赵之绪，复构藏经楼于其侧。”这就说明藏经楼就建在考祠的侧边。赵之绪在建藏经楼的同时，还购经史子集诸书籍存于楼中。该楼建在大石山之上，据推测应该是在老君殿，又称雷神殿：该殿坐东朝西。占地面积105平方米，建筑面积313平方米。共三层楼房，二层殿堂面阔三间，通面阔8.1米，进深二间，通进深6.7米，四周为圈廊，穿斗式三层重檐歇山青筒瓦顶。格扇门窗，吊脚楼。顶层楼棚下悬有黑漆鎏金匾额“紫气东来”四大字。中层供祀雷祖(殷太师闻仲)及雷公电母三尊塑像。这样的建筑，有利于通风干燥，既为防止图书潮湿、虫蛀，又可以防火。因而，藏书楼是阁楼式建筑，并且是书院中唯一的一种建筑方式，因而显得特别飘逸，是书院中的一景。

　　紫阳书院斋舍：又称学舍，是师生住宿用餐之地，一般建于讲堂和祠堂的两侧或后面。紫阳书院的斋舍，按规制推测，应该建在圣人殿之地。圣人殿：坐东朝西，占地面积110平方米，建筑面积220平方米。底层殿堂面阔三间，通面阔8.6米，进深三间，通进深6.8米。上层立朱文公和孔子牌位。穿斗式重檐歇山青筒瓦顶。格扇门窗，基架空。楹联：潕水绕岩疆，万树烟霞，千里江山如画;吉光盈古殿，满蹊桃李，百年文教方兴。二层高4.1米，周围廊，半壁花窗，每扇花窗高2.42米，宽0.6米。底部各有一直径为0.15米的雕花圆圈，圈内藏隐木雕空心楹联“潕水无双福地;黔山第一洞天”十二字。下层供祀千手观音塑像和酒神杜康塑像。如果圣人殿处不是斋舍，那就必在其他地方另建一楼供师生住宿。这样斋舍离祠堂、讲堂较近，方便师生的学习及生活。斋舍的主要功能是供师生休息，为避免在一所斋舍里因住宿者过多而造成种种不便，因而书院斋舍面积较小，但间数较多。并且斋舍的多寡视书院住宿师生的数额而定，因而从斋舍的数量，亦可在一定程度上反映出书院的规模。

　　紫阳书院环境：位于山腰悬崖边的紫阳书院，它的后面是高高的悬崖，前面一小块空地，空地前面也是悬崖，沿纵深方向的尺度较小，不可能由建筑完全围合形成院落，只好把房屋建在外侧的悬崖边上，通过外侧的建筑与内侧的崖壁共同围合成院落。也正是因为受地形影响严重，院落的形状形成了随形就势的自由形状，不可能形成方正规矩。这样的院落，背后十多丈高的笔真陡峭悬崖和前面高耸的楼阁建筑共同围合而成，形成一种高深空间，烘托出静谧、幽暗的环境特色，为书院教学营造出一种高深静谧的氛围。这里的院落形成了书院的游憩部分，结合周围的自然环境设置园林，布置三角亭，以供师生休憩、赏览、陶冶情操。使生童置身于美的环境之中，得到美的陶冶，这是有意识地将美景纳入到书院建设之中，使之成为审美教育的重要组成部分。